在人体体表和与外界相通的腔道中经常寄居着大量的微生物, 通称为正常微生物群或正常菌群。其对人体是必需的, 绝大部分是有益无害的。
一个健康成年人大约有1×1013个体细胞, 而全身定植的正常微生物总数高达1×1014个,主要分布于皮肤、口腔 、消化道、 呼吸道和泌尿生殖道。女性下生殖道为开放性腔道,是人体内重要微生态区, 女性阴道微生态体系是由阴道内的微生物菌群、周期性的内分泌变化、阴道的局部免疫和阴道解剖结构共同组成，其中阴道菌群是阴道微生态研究的核心内容。
阴道微生态已成为一门独立的学科，受到临床医生及医药研究者的高度重视。随着阴道微生态学科的发展，阴道微生态学正在从保健医学迈向治疗医学和预防医学。
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